| 1999年09月 |
医療機関の業務合理化、医薬品流通の効率化を目的として、札幌市中央区に株式会社メディカルシステムネットワーク（資本金10百万円）を設立 |
| 1999年11月 |
「医薬品情報システム」が完成、医薬品システム関連業務を開始 |
| 1999年12月 |
FAXによる医薬品売買仲立ちを開始 |
| 2000年01月 |
債権流動化サポート業務開始 |
| 2000年04月 |
医薬品ネットワークシステム（0/E system）が完成、稼動開始 |
| 2001年03月 |
有限会社システム・フォー（後に株式会社システム・フォー）を子会社化 |
| 2001年07月 |
株式会社システム・フォーを株式交換にて100%子会社化 |
| 2002年03月 |
大阪証券取引所ナスダック・ジャパン市場上場 |
| 2002年12月 |
株式会社ファーマホールディング及び株式会社日本レーベンの株式を100%取得し子会社化 |
| 2005年02月 |
三井物産株式会社と共同出資にて株式会社エムエムネット（資本金200百万円、当社51%保有）を設立 |
| 2005年10月 |
株式会社ファーマホールディングが株式会社サンメディック（現株式会社なの花東日本）の株式を100%取得し子会社化、同時に株式会社阪急共栄ファーマシー（現株式会社なの花西日本）の株式を100%取得し子会社化 |
| 2007年01月 |
有限会社シー・アール・メディカル（現株式会社なの花中部）の出資口を100%取得し子会社化 |
| 2007年03月 |
株式会社北海道ハイクリップス（後に商号変更し株式会社エスエムオーメディシス）の株式を100%取得し子会社化 |
| 2008年09月 |
東京証券取引所市場第二部上場 |
| 2008年11月 |
大阪証券取引所ニッポン・ニュー・マーケット「ヘラクレス」市場上場廃止 |
| 2010年06月 |
東京証券取引所市場第一部指定 |
| 2013年05月 |
株式会社ファミリーマートと業務提携、三井物産株式会社との資本業務提携解消に伴い、株式会社エムエムネットを完全子会社化 |
| 2013年07月 |
株式会社エムエムネットを吸収合併 |
| 2013年11月 |
株式会社ファーマホールディングが株式会社トータル・メディカルサービス（現株式会社なの花九州）の株式を株式公開買付けにより98.96%取得し子会社化 |
| 2015年01月 |
芙蓉総合リース株式会社と戦略的包括提携 |
| 2015年04月 |
株式会社イーエムシステムズと業務提携 |
| 2015年06月 |
薬樹株式会社と業務提携 |
| 2016年05月 |
株式会社ファーマホールディングが株式会社ひまわり看護ステーションの株式を100%取得し、訪問看護事業を開始 |
| 2016年10月 |
株式会社ズーと業務提携 |
| 2017年05月 |
オークラ情報システム株式会社と業務提携 |
| 2017年06月 |
株式会社エスエムオーメディシスを株式譲渡により非子会社化 |
| 2017年10月 |
株式会社システム・フォー、株式会社ファーマホールディング及び株式会社日本レーベンを吸収合併 |
| 2018年01月 |
株式会社アポテック（現株式会社なの花東北）の株式を100%取得し子会社化、株式会社ポラリスと業務提携 |
| 2018年02月 |
株式会社フェルゼンファーマがダイト株式会社と業務提携 |
| 2018年06月 |
株式会社フェルゼンファーマが後発医薬品の販売を開始 |
| 2019年01月 |
永冨調剤薬局（現株式会社なの花九州）の株式を100%取得し子会社化 |
| 2020年10月 |
株式会社オプト（現株式会社リテイギ）と合弁契約を締結し、株式会社ファーマシフトを設立、デジタルシフト事業を開始 |
| 2021年07月 |
株式会社ひまわり看護ステーションを吸収合併 |
| 2022年04月 |
東京証券取引所の市場区分の見直しにより市場第一部からプライム市場へ移行 |
| 2023年06月 |
監査等委員会設置会社へ移行 |
| 2023年10月 |
東京証券取引所プライム市場からスタンダード市場へ移行 |
| 2023年11月 |
株式会社ファーマシフトの発行済株式を追加取得し、完全子会社化 |
| 2024年04月 |
株式会社メディロジネットを設立、医薬品物流事業を開始 |
| 2025年02月 |
株式会社ファルモが自己株式を取得したことに伴い、同社を持分法適用関連会社化 |
